Добро пожаловать в Академию кукол — элитное учебное заведение, где нелюдимыми отшельниками живут не студенты, а их марионетки. Каждый абитуриент, поступая сюда, обязан привезти с собой куклу, которая станет его единственным инструментом и оружием на ближайшие четыре года. Дело в том, что в этом мире магия не работает напрямую: она течет через специальные артефакты, встроенные в тела кукол, и только через них человек может колдовать. Студенты осваивают боевую магию, алхимию и управление марионетками, но главный секрет академии кроется в том, что куклы постепенно обретают собственное сознание. Они начинают чувствовать боль, радость, ревность и ненависть, а иногда — влюбляться в своих хозяев или затаивать на них смертельную обиду. Главный герой, парень по имени Рен, поступает в академию не за славой, а чтобы найти способ вернуть к жизни свою младшую сестру, которая впала в магическую кому. Единственная зацепка — старинная кукла, доставшаяся ему от родителей, которая, как выясняется, хранит в себе душу древнего мага. Но эта кукла ведет себя странно: она отказывается подчиняться, говорит голосом сестры и требует, чтобы Рен не пытался её воскресить, иначе погибнут все.
Второй семестр переворачивает всё с ног на голову. Оказывается, академия — это не просто школа, а гигантский эксперимент по созданию идеального солдата, где куклы служат лишь расходным материалом. Рен и его однокурсники сталкиваются с подпольным клубом, члены которого пытаются освободить марионеток от контроля людей, и с коррумпированными преподавателями, которые тайно крадут души студентов, чтобы усилить своих кукол. Ситуация накаляется, когда начинают пропадать ученики, а их куклы сходят с ума и нападают на живых. Рену приходится объединиться с дерзкой девушкой-механиком, которая чинит кукол, и загадочным парнем, чья марионетка умеет стирать память. Вместе они раскрывают, что основатель академии запечатал в подвалах школы древнее божество, которое питается энергией привязанности между человеком и куклой. И теперь, когда куклы начали бунтовать, божество пробуждается, чтобы поглотить всех. Рен оказывается перед выбором: пожертвовать своей куклой, в которой живет душа сестры, чтобы спасти академию, или позволить божеству уничтожить всё, но сохранить последнюю надежду на её воскрешение. В финале выясняется, что сестра сама согласилась стать куклой, чтобы защитить брата от проклятия, и теперь её истинная сущность — это ключ к разрушению всей системы академии. Рену предстоит принять правду и отпустить прошлое, чтобы построить будущее, где куклы и люди смогут сосуществовать как равные, а не как хозяева и рабы.
