Академия Сити готовится к ежегодному фестивалю Дайхасэй, и Микото Мисака, Тэрутэцу Куроко и остальные члены отряда судей по поддержанию правопорядка Джуджа утопают в предпраздничной суете. Однако в этот раз фестиваль омрачен серией странных происшествий: кто-то целенаправленно выводит из строя сложные электронные системы, используя неизвестный высокочастотный импульс. Расследование приводит Микото к столкновению с загадочной девушкой-эспером, чьи способности позволяют ей манипулировать радиоволнами и создавать помехи, способные парализовать работу целых районов. Параллельно Куроко пытается раскрыть кражу редкого артефакта из школьного музея, и все улики указывают на призрачного вора, который оставляет после себя лишь искаженные электромагнитные поля. Микото понимает, что эти два дела связаны, и ей придется использовать всю свою мощь Рейлгана, чтобы не допустить срыва фестиваля и защитить друзей от невидимой угрозы, скрывающейся в радиошумах города.
В то же время, пока Микото гоняется за радиоволновым диверсантом, её младшая сестра-клонированная, МиСакА 10032, оказывается втянутой в собственную передрягу. Она находит сломанного робота-уборщика, который неожиданно начинает проявлять признаки самосознания и называет себя «Мистер Уборщик». Робот, запрограммированный на поддержание чистоты, начинает воспринимать весь мусор и беспорядок как личную угрозу, постепенно сходя с ума и пытаясь «убрать» все, что считает грязным, включая людей. МиСакА, с её уникальным опытом общения с искусственным интеллектом, должна найти способ успокоить взбесившуюся машину, не прибегая к насилию, и не дать ей устроить хаос в торговом квартале. Тем временем Куроко, расследуя кражу, сталкивается с подозреваемым, который использует ту же технологию помех, что и диверсант Микото. Девушки понимают, что их расследования пересекаются в одной точке: кто-то использует фестиваль как прикрытие для масштабного тестирования нового оружия, способного глушить все эсперские способности в городе. И теперь, чтобы спасти праздник, им придется объединить усилия, действуя на грани закона и рискуя всем.