Второй сезон аниме «Мы не можем учиться!» подхватывает историю ровно в тот момент, когда Юига Юдзуру, гениальный, но бедный старшеклассник, окончательно запутывается в своих отношениях с тремя одаренными, но безнадежными в учебе девушками. Фумино Фурухаси, гений литературы, которая мечтает поступить на медицинский факультет, продолжает бороться с точными науками, но теперь её чувства к Юдзуру становятся всё более очевидными, хотя она упорно отказывается их признавать. Огромная и добрая Урука Такэмото, спортивная звезда, нацелившаяся на престижный университет, тоже не отстает: её попытки совместить тренировки с учебой приводят к новым комичным ситуациям, а её прямота и искренность всё чаще ставят Юдзуру в тупик. И, конечно, Рицу Уэноки, холодная красавица и гений химии, которая мечтает стать художницей, продолжает свои странные эксперименты, балансируя между аристократической сдержанностью и растущей симпатией к своему репетитору. В этом сезоне к ним присоединяется младшая сестра Юдзуру, Мидзуки, чья чрезмерная опека и подозрения вносят дополнительный хаос, а также загадочная Асуми Курусу, которая, кажется, знает о Юдзуру больше, чем кто-либо.
Вместо того чтобы сосредотачиваться исключительно на зубрежке, второй сезон углубляется в личные драмы и неловкие признания. Школьный фестиваль, совместные поездки на горячие источники, подготовка к экзаменам и случайные ночевки — каждый эпизод наполнен ситуациями, где герои оказываются в тесном контакте, заставляя их краснеть и сомневаться в своих намерениях. Юдзуру, который изначально видел в девушках лишь подопечных, всё чаще ловит себя на мысли, что его сердце разрывается между тремя совершенно разными, но одинаково привлекательными личностями. Фумино пытается скрыть ревность, Урука действует напролом, а Рицу использует логику, чтобы объяснить свои чувства, но все они сходятся в одном: их «невозможность учиться» теперь связана не с плохими оценками, а с тем, что мысли о Юдзуру отвлекают их гораздо сильнее, чем любые учебники. Сезон заканчивается на напряженной ноте, оставляя зрителя в ожидании финального выбора, который перевернет жизнь всей четверки.
